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干貨間 | 簡單7步搞定KEGG富集分析

2018-07-31


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文案 | 轉錄調控事業部


隨著測序通量的提高,利用高通量測序技術進行轉錄組研究來揭示相關分子機制已經越來越普遍,轉錄組研究結果的重點挖掘一般是放在差異基因上,主要研究差異基因到底是行使怎樣的功能,參與哪些代謝通路,然后根據這些功能和代謝通路分析來闡述引起差異的相關分子機制。


對于挖掘到的目的基因,想要簡單的做個KEGG富集分析看看結果的老師們,我們今天特意準備了關于在線做KEGG富集分析的小技能介紹,簡單7步即可順利完成,走過路過不要錯過呀!




第一步



? 首先百度搜索KEGG,打開圖中KEGG官網鏈接



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第二步



? 將打開的界面拉至最下方,然后點擊BLASTKOALA



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第三步



? 上傳目標基因的氨基酸序列FASTA 文件



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第四步



? 選擇您的物種類別



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第五步



? 輸入您的郵箱



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第六步



? 提交



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第七步



? 收到郵件,點擊右鍵中確認提交任務的鏈接,將進入新的網址,內容顯示正在計算,計算完成后會將結果網址發送至您的郵箱,然后點擊結果鏈接,就能看到結果了。點擊紅色標注區域,可以看到通路圖,通路中富集的基因會被綠色標注出來。



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備注



基因的核酸序列如何轉化為蛋白的氨基酸序列,有很多種方法,在線或者軟件DNAMAN 或者mega均可,只需下載軟件安裝,然后將基因序列復制粘貼,點擊translate即可。


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