2016-01-07
簡介：
梨小食心蟲為重要的寡食性害蟲，分布范圍較廣，對梨樹嫩葉及果實等部位為害嚴重。梨小食心蟲除危害梨、桃樹外，也危害李、杏、蘋果、山楂等，嚴重影響果品質量及梨果產量。梨小食心蟲成蟲觸角在尋找寄主植物、交配、產卵等過程中發揮重要作用。西北農林科技大學植物保護資源和害蟲管理實驗室的仵均祥教授和他的團隊以梨小食心蟲觸角做為樣本進行轉錄組測序，鑒定嗅覺相關基因。結果共鑒定出124個嗅覺相關基因，其中118個基因為該物種中新發現的，包括28個編碼氣味結合蛋白的轉錄本，17個化學感受蛋白，48個氣味感受器，4個味覺感受器，24個親離子受體，2個感覺神經膜蛋白及1個氣味降解酶。
國內基因測序公司派森諾生物測序項目文章：梨小食心蟲轉錄組測序。文章研究為今后害蟲味覺識別的研究提供了分子研究基礎，特別是為使用化學信息素控制害蟲提供了可行性。該研究成果Identificationof Putative Olfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis于2015年11月5日發表在PLoS ONE（影響因子3.234）雜志上。梨小食心蟲的轉錄組測序及信息分析工作，由上海派森諾生物科技股份有限公司完成。
方法：
用棉簽蘸5%蜂蜜溶液喂養雌幼蟲，對3-4天后剛羽化的1200個飛蛾的觸角進行轉錄組測序
樣本量：
1個樣本
測序平臺：
Illumina MiSeq 平臺
分析內容：
1. 共有基因和特有基因分析
2. 基因表達差異分析
3. 聚類分析
4. eggNOG注釋
5. KEGG注釋
6. qPCR驗證
結果：
共鑒定出124個嗅覺相關基因，其中118個基因為該物種中新發現的，包括28個編碼氣味結合蛋白的轉錄本，17個化學感受蛋白，48個氣味感受器，4個味覺感受器，24個親離子受體，2個感覺神經膜蛋白及1個氣味降解酶。
結果展示：
圖1 轉錄組數據不同比對方式比較
圖2 OBP及CSP基因系統發生樹構建
圖3 梨小食心蟲轉錄組測序GO基因功能注釋
參考文獻：
Guangwei Li, Juan Du. Identification of PutativeOlfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis. PLoS One. (2015)1-30.
原文索引：10.1371/journal.pone.0142193
本文由派森諾生物技術支持徐寧寧整理
