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木霉自動化檢索系統正式上線

2016-02-17

前沿導讀   

近日,由上海派森諾生物科技股份有限公司與上海交通大學農業與生物學院陳捷教授課題組合作完成的木霉分類鑒定自動化檢索系統正式上線(網址:http://mmit.china-cctc.org)。2016年1月24日,該系統順利通過科技部及來自全國范圍內的木霉分類鑒定專家的檢驗,并受到與會專家的一致好評。具有自主知識產權的木霉分類鑒定系統。


 木霉自動化檢索系統

圖1 木霉分類鑒定自動化檢索系統主頁

   


相比于國際同類的木霉分類鑒定系統(如http://isth.info/isth/tools/molkey/和 https://nt.ars-grin.gov/fungaldatabases/),該系統的主要優勢在于既能單獨利用木霉分子序列數據(ITS序列數據和TEF-1a序列數據)或形態學數據(總共包含 28 種形態學數據)進行檢索;同時也能將分子序列數據與形態學數據結合,通過交互式檢索,為木霉的分類鑒定提供線索。



木霉研究背景及意義   


木霉(Trichoderma Pers.ex Fr.)屬真菌屬于半知菌亞門、絲孢綱、絲孢目的黏菌種類,分布十分廣泛。它既能產纖維素酶、葡聚糖酶、木聚糖酶、幾丁質酶和蛋白酶等酶類化合物,又能合成核黃素、生產抗生素、轉化甾族化合物,是工業制劑的一種重要生產菌;同時,由于該菌與植物共生時能促進植物的生長發育,且能誘導并誘發植物自身免疫功能,因此也能作為植物病害生物防治的工程菌。此次,木霉分類鑒定系統的建立,將推動木霉的基礎研究,從而為木霉的應用打下堅實的基礎。

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