2016-03-21
派森諾生物與武漢紡織大學彭其安老師攜手合作,應用高通量測序的方法及宏基因組分析手段對不同類型水稻土中鐵還原細菌的多樣性變化做了相關研究。
通過對四種不同樣品:潛江市水稻油菜輪作土壤(QR)與水稻淹水期土壤(QF),咸寧市稻油菜輪作土壤(XR)與水稻淹水期土壤(XF))的土壤進行分析,研究土壤之中微生物多樣性的變化規律。研究成果《The diversity of iron reducing bacteria communities in subtropicalpaddy soils of China》發表在Applied Soil Ecology上。
1、利用高通量測序的技術鑒定到鐵還原細菌中比較稀有的門分類細菌,如Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Cyanobacteria,Nitrospira, Spirochaetes與 Verrucomicrobia;
2、在鐵還原細菌中相對豐度占有比較高的Proteobacteria,Sphingomonas,Pandoraea與Azospira均是發現;
3、Sphingomonas、Pandoraea與 Azospira等可能參與了水稻土中Fe3+的還原過程;
4、CCA分析結果顯示土壤酸堿度對XR水稻土樣品中的鐵還原細菌結構有顯著影響。
圖1 稀疏曲線分析
圖2 Venn圖
圖3 物種豐度分布圖
圖4 熱圖分析
圖5 CCA分析
結果表明,我國亞熱帶水稻土鐵還原細菌的多樣性主要取決于作物輪作的確定,另外,水稻土的酸堿度和碳氮比也對細菌群落組成的變化有著重要影響。
原文索引:Peng QA, Shaaban M, Wu Y, et al. The diversity of ironreducing bacteria communities in subtropical paddy soils of China[J]. AppliedSoil Ecology, 2016, 101:20–27.