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動物線粒體全基因組測序知多少?

2016-03-21

   什么是線粒體基因組?  

 


   線粒體    

 

       線粒體(Mitochondrion)是一種存在于大多數真核細胞中的由雙層膜包被的細胞器。它是細胞中制造能量的結構,是細胞進行有氧呼吸的主要場所,被稱為“power house”。除了為細胞供能外,線粒體還參與細胞分化、細胞信息傳遞和細胞凋亡等過程,并擁有調控細胞生長和細胞周期的能力。

動物線粒體全基因組測序圖


   線粒體基因組   

 

        線粒體擁有自身的遺傳物質和遺傳體系。通常而言,一個線粒體包含2~10份拷貝的線粒體 DNA(mtDNA)。動物 mtDNA 呈雙鏈環狀,其基因組大小介于 11~28 kb。以人類 mtDNA 為例,其長度為16,569 bp,包含 37 個基因(13 個蛋白編碼基因、2個 rRNA 基因和 22 個 tRNA 基因)和 1 個非編碼區(富含AT的控制區)。



動物線粒體全基因組測序


 

 

   線粒體基因組的應用   

 

    所有 mtDNA 以單體型進行遺傳,幾乎不發生基因重組,是生物學家研究物種群體遺傳學和進化生物學的理想材料。相比于核基因組,mtDNA 拷貝數高,穩定性好,是考古學家和法醫學家開展工作的重要對象。在醫學領域,線粒體疾病是一種常見的遺傳紊亂,醫學科研工作者常利用 mtDNA 來研究、診斷及治療線粒體疾病。

 

  如果獲取線粒體基因組序列  

   傳統方法   

 

     策略:根據參考基因組序列,設計簡并引物,進行長距離 PCR 擴增,并采用一代測序方法獲得 mtDNA 序列;

     缺點:項目周期長;無法確保獲得全長 mtDNA 序列。


   主流方法   

 

     策略:分離獲得線粒體細胞器,抽提線粒體基因組 DNA,采用高通量測序獲得 mtDNA 序列;

     缺點:獲得純的線粒體細胞器費時費力。


   選擇派森諾的優勢在哪里?  

 

   

        客戶僅需提供富含線粒體的組織、細胞或全基因組總 DNA,派森諾幫您獲得線粒體 mtDNA 序列。


   經驗豐富、周期短   

 

       派森諾在線粒體基因組測序服務方面經驗豐富,已成功獲得多個物種的線粒體 mtDNA 序列。從樣品提供到獲得線粒體 mtDNA 序列,僅需要 1 個月的時間,極大地提高了科研工作者的研究效率。


   分析內容豐富   

       

       提供拼接的 mtDNA 序列僅是我們優質服務的一小部分,除此之外,我們還提供包括注釋、可視化、進化分析等等服務。


   注釋高清   

        注 釋(均以高清圖片形式呈現,如以下注釋內容和圖片)


動物線粒體全基因組測序之tRNA 二級結構預測
tRNA 二級結構預測



mtDNA 拷貝數分析


動物線粒體全基因組測序之mtDNA 異質性分析

mtDNA 異質性分析


動物線粒體全基因組測序之mtDNA 突變分析

mtDNA 突變分析

動物線粒體全基因組測序之進化分析
進化分析


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