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全基因組重測序檢測自閉癥突變特征

2016-10-28

研究背景

自閉癥,又稱孤獨(dú)癥,主要特征是漠視情感、拒絕交流、語言發(fā)育遲滯、行為重復(fù)刻板以及活動興趣范圍的顯著局限性,一般在3歲以前就會表現(xiàn)出來。其發(fā)病原因有多種,已確定遺傳因素對自閉癥作用明確,但具體因素尚不明確。


研究結(jié)果 

新生突變(de novo mutations, DNMs)是導(dǎo)致自閉癥的重要因素,此前對自閉癥新生突變的研究中,只對編碼區(qū)的1.5%基因進(jìn)行過測序。研究者選取了200對父母和孩子的種系樣品,通過Hiseq平臺對樣品進(jìn)行了全基因組的重測序。結(jié)果發(fā)現(xiàn)大部分種系DNMs(75.6%)來自父親,且隨著父親年齡增加而增加。然而,大部分簇的DNMs來自于母親,且與新生CNVs突變相鄰。同時,檢測到大量有破壞性的突變存在于非編碼區(qū)(15.6%)和遺傳非編碼區(qū)(22.5%),雖然這些非編碼區(qū)的突變基因不會被翻譯,但是他們參與調(diào)控外顯子跳躍或者處于脫氧核糖酶I的高敏感區(qū)域。

對發(fā)生DNMs突變類型進(jìn)行統(tǒng)計,具體結(jié)果見圖1。

 

圖1:DNMs突變類型


對樣品的家系、簇族和體細(xì)胞的突變進(jìn)行檢測,分析突變來源,具體結(jié)果見圖2。

 

 圖2:自閉癥突變來源檢測


同時,通過重測序?qū)悠分衅茐男缘耐蛔冞M(jìn)行檢測,同時驗(yàn)證這些突變對功能的影響,具體結(jié)果見圖3。

 

 圖3:破壞性突變對功能的影響


結(jié)論 

研究者通過對200個家庭共600人進(jìn)行了全基因組的重測序,對自閉癥進(jìn)行了研究,為自閉癥提供了各種類型基因突變類型的閾值模型,對自閉癥的遺傳因素有更新的認(rèn)知。

參考文獻(xiàn) 

Yuen, RK, et al. Genome-wide characteristics of de novo mutations in autism. NPJ genomic medicine, 1, 16027-1.

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