2017-03-03
該研究于2016年發(fā)表于期刊《Peer.J》上
（最新影響因子：2.183）
研究背景：
在之前的研究中很多微生物都因為不可培養(yǎng)使得我們無從得知它們的信息，而高通量測序技術(shù)的誕生為我們開啟了微生物組研究的大門。很多地球上極端環(huán)境中的微生物都是通過這種方法獲得鑒定。除了地球上廣為人知的極端環(huán)境之外，我們?nèi)祟愖≌衅鋵嵰泊嬖谥恍O端生境，比如處于極端溫度、pH和理化條件下的熱水器等生境，其中的微生物群落的分布和物種組成特征尚且未知。
研究方法：
樣本來源：羅利達(dá)勒姆都市6個住宅中10處標(biāo)準(zhǔn)化極端生境中的水樣，包括洗碗機(jī)（極端溫度）、熱水器（極端溫度）、洗衣機(jī)（極端pH、極端化學(xué)環(huán)境），通過拭子或吸管進(jìn)行取樣。
測序平臺：Roche 454 FLX（16S rRNA基因V4區(qū)）
研究結(jié)果：
OTU累積曲線和稀疏曲線顯示，極端溫度條件下比極端pH和極端化學(xué)環(huán)境下的微生物多樣性更高；極端溫度環(huán)境比一般溫度環(huán)境微生物更多樣；極端pH條件下的微生物多樣性也更高；但極端化學(xué)環(huán)境下的微生物多樣性則較低。
NMDS分析結(jié)果顯示出多種極端環(huán)境之間的相互關(guān)系，在極端溫度環(huán)境與極端pH環(huán)境或極端化學(xué)環(huán)境共存時，微生物群落的組成與其他多重環(huán)境下差異明顯。以A、B圖為例，極端溫度環(huán)境與極端pH環(huán)境共存時，相比極端溫度環(huán)境+非極端pH環(huán)境、非極端溫度環(huán)境+極端pH環(huán)境或者非極端溫度環(huán)境+非極端pH環(huán)境，物種組成明顯不同。
Beta多樣性分析也表明，在極端溫度與極端pH環(huán)境或極端化學(xué)環(huán)境共存時，微生物群落呈現(xiàn)出截然不同的物種組成。
住宅普通環(huán)境中遍布的微生物物種中，有44%與極端環(huán)境下的微生物物種不同。同時，有20個物種只存在于極端環(huán)境中，其中，有9種在三種極端環(huán)境下都存在，有5種只存在于極端溫度環(huán)境中。
研究結(jié)論：
綜上所述，雖然住宅中極端環(huán)境下的微生物比周圍環(huán)境下的微生物都要少，但是也有相當(dāng)多樣化的物種存在于各種極端生境。同時，不同極端環(huán)境共存時，微生物群落的組成具有明顯差異，尤其是當(dāng)極端溫度與極端pH或極端化學(xué)環(huán)境共存時，微生物的物種種類最少。
參考文獻(xiàn)
Savage AM, Hills J, Driscoll K, Fergus DJ, Grunden AM, Dunn RR. PeerJ.(2016). Microbial Diversity of Extreme Habitats in Human Homes. Sep 13；4：e2376.
