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生態互聯,元素交響 | 派森諾生物地球化學循環分析項目盛大發布

2024-08-12

生物地球化學循環項目官宣-(3).jpg

生物地球化學循環是當前地球科學領域研究的重點內容之一,描述了生物圈與地球其他圈層(如大氣圈、水圈、土壤全、巖石圈)之間物質和能量的轉移。微生物不僅是生態系統中最基礎且最為豐富的生物組成部分,更是生物地球化學循環中無可替代的驅動力。作為地球化學元素轉化的首要執行者,微生物通過其獨特的代謝途徑,深刻影響著碳、氮、磷、硫等關鍵元素的生物可用性與地球環境的化學平衡。

宏基因組能夠揭示微生物參與復雜生物地球化學過程的遺傳潛能與功能途徑,通過挖掘宏基因數據,可以識別出微生物參與特定元素循環的關鍵基因、代謝通路和發揮作用的酶,為了更全面、更系統地解析微生物在多種元素循環中的作用(包括碳、氮、磷、硫、鐵、砷、汞、硒),派森諾技術團隊通過整合KEGG、Metacyc、CAZy、KOFAM、Pfam、TIGRfam、dbCan2、MEROPs、Mcyc、Ncyc、Pcyc、Scyc、FeGenie、Asgenedb等多個數據庫中與元素循環相關的功能基因集,推出宏基因組生物地球化學循環分析。



PSN生物地球化學循環功能基因集

PSN生物地球化學循環功能基因集包含9大子庫,總計收集107條功能通路,標記基因累計高達1225個。

數字版(1).jpg

PSN生物地球化學循環項目分析優勢

?多庫融合解析元素循環!

?突破碳氮磷硫,全景元素動態盡在掌握!

?分析圖表大集合一站式交付!

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PSN生物地球化學循環功能基因集詳細信息



部分分析結果展示

?多庫融合建設全面功能基因集,豐富圖表搭建實用分析報告。

?PSN生物地球化學循環項目報告提供功能通路循環圖、功能通路/功能基因豐度統計、差異比較、功能通路物種貢獻度分析等多維結果。

?Nature、Science等國際頂級期刊的專業配色方案,實用又美觀!

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圖1代謝通路循環圖、功能通路組成堆積柱形圖

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圖2 功能通路與功能基因組成熱圖

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圖3 功能通路LEfSe分析分類學分支圖與LDA柱形圖

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圖4 功能通路與功能基因差異分析

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圖5 物種對代謝通路的貢獻度堆積柱形圖、桑基圖



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