Cut&Tag-seq
CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是蛋白質(zhì)-DNA互作關(guān)系研究的新方法，是新一代超微量ChIP-Seq技術(shù)，適用于無ChIP級(jí)別抗體的蛋白研究。與傳統(tǒng)的ChIP-Seq研究方法相比，該技術(shù)無需交聯(lián)、超聲打斷、末端抹平和接頭連接等操作，因此具有省時(shí)高效、所需的樣品量少、背景信號(hào)低和可重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn)，甚至可用于單細(xì)胞水平測(cè)序。CUT&Tag有望將蛋白質(zhì)-DNA互作的研究變成一種類似PCR反應(yīng)的常規(guī)操作，對(duì)基因調(diào)控、表觀遺傳等領(lǐng)域的研究具有革命性的意義。
技術(shù)原理：CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）技術(shù)，該技術(shù)利用一抗靶向結(jié)合目的蛋白，二抗孵育放大信號(hào)，創(chuàng)新性的pA-Tn5融合蛋白與一抗和二抗中的Fc區(qū)結(jié)合，Mg2+激活pA-Tn5的Tn5酶活性后切割目標(biāo)區(qū)域并加上接頭，經(jīng)PCR擴(kuò)增就可獲得目標(biāo)蛋白結(jié)合區(qū)域的文庫。簡(jiǎn)化建庫操作，提高了信噪比，實(shí)現(xiàn)了低細(xì)胞量樣本研究組蛋白修飾和轉(zhuǎn)錄因子的目標(biāo)。
推薦平臺(tái)：Novaseq 6000 PE150
生物信息分析
1.原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評(píng)估
2.與參考基因組序列比對(duì)
3.Peak Calling（統(tǒng)計(jì)每個(gè)樣品的Peak片段信息）
4.基因附近及Peak中心信號(hào)分布圖
5.Peak序列Motif及注釋分析
6.Peak鄰近基因功能分析
7.差異Peak序列Motif及注釋分析
8.差異Peak鄰近基因功能分析
9.Overlap基因功能分析
派森諾的優(yōu)勢(shì)
1.根據(jù)實(shí)際需求可個(gè)性化定制測(cè)序及分析方案。
2.嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)流程和檢測(cè)結(jié)果，數(shù)據(jù)分析結(jié)果可信。
3.分析結(jié)果的圖表參考國(guó)際期刊設(shè)計(jì)，可直接用于文章寫作。
4.與轉(zhuǎn)錄組等數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合分析，挖掘生物信息資源。
